5’AMP活化蛋白激酶(5’AMP activated protein kinase;AMPK)屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶(serine/threonine protein kinase)家屬成員之一。其為從酵母到人體高度進(jìn)化保留的激酶復(fù)合物,由3個(gè)亞體,α、β、γ構(gòu)成:其中γ亞體有4個(gè)胱硫醚β合酶(cystathione beta synthase;CBS)結(jié)構(gòu)域,又稱為巴特曼(Bateman)結(jié)構(gòu)域,以探測(cè)AMP和ATP的比例;α亞體含有催化結(jié)構(gòu)域,一旦收到AMPKK或LKB1/MO25/STRAD 復(fù)合物催化的磷酸化后,AMPK被激活。所有亞體都有不同異構(gòu)體形式,包括α1、α2、β1、β2、γ1、γ2和γ3。其功能在于保持細(xì)胞能量?jī)?nèi)環(huán)境恒定:促進(jìn)脂肪酸β氧化、抑制膽固醇合成、促進(jìn)肌肉葡萄糖吸收和調(diào)節(jié)胰島素分泌等。AMPK在肝臟、腦和肌肉組織中高度表達(dá)。其磷酸化目標(biāo)序列為 LKKLTRASFFGQ。基于底物L(fēng)KKLTRASFFGQ,在ATP的存在下,受到5’AMP活化蛋白激酶的磷酸化,獲得產(chǎn)物磷酸化多肽,進(jìn)而通過丙酮酸激酶(pyruvate kinase;PK)和乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase;LDH)反應(yīng)系統(tǒng)中,還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(reduced nicotinamide adenine dinucleotide;NADH)轉(zhuǎn)化為氧化型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide;NAD),其吸光峰值的變化(340nm),來定量分析5’AMP活化蛋白激酶的活性。其反應(yīng)方式為:
AMPK
LKKLTRASFFGQ + ATP → LKKLTRApSFFGQ + ADP
pyruvate kinase
Phosphoenolpyruvate + ADP → pyruvate + ATP
lactate dehydrogenase
pyruvate + NADH → lactate + NAD+
(高吸收峰) (低吸收峰)
產(chǎn)品內(nèi)容
HEPENGBIO清理液(Reagent A) 120毫升
HEPENGBIO裂解液(Reagent B) 10毫升
HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) 4毫升
HEPENGBIO酶促液(Reagent D) 500微升
HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E) 500微升
HEPENGBIO底物液(Reagent F) 500微升
HEPENGBIO陰性液(Reagent G) 500微升
保存方式
保存HEPENGBIO清理液(Reagent A)在4℃冰箱里;其余的保存在-20℃冰箱里,嚴(yán)格避免光照和反復(fù)凍融;有效保證6月
用戶自備
AMPK激酶:用于抑制劑篩選
1.5毫升離心管:用于樣品保存的容器
15毫升錐形離心管:用于樣品處理的容器
細(xì)胞刮脫棒:用于貼壁細(xì)胞脫離
(微型)臺(tái)式離心機(jī):用于細(xì)胞預(yù)處理
200微升1厘米光徑比色皿或96孔板:用于光度分析操作的容器
分光光度儀或酶標(biāo)儀:用于樣品光度分析
實(shí)驗(yàn)步驟
一、 待測(cè)樣品準(zhǔn)備
1. 準(zhǔn)備好75cm2細(xì)胞培養(yǎng)瓶或100mm細(xì)胞培養(yǎng)皿的待測(cè)培養(yǎng)細(xì)胞(1至5 X 107細(xì)胞)
2. 小心加入3毫升HEPENGBIO清理液(Reagent A),覆蓋生長(zhǎng)表面
3. 小心抽去清理液
4. 使用細(xì)胞刮脫棒輕柔刮脫細(xì)胞(注意:避免使用胰酶消化)
5. 加入3毫升HEPENGBIO清理液(Reagent A),混勻細(xì)胞
6. 移入到預(yù)冷的15毫升錐形離心管(注意:懸浮細(xì)胞從這一步驟開始)
7. 放進(jìn)4℃臺(tái)式離心機(jī)離心5分鐘,速度為300g
8. 小心抽去上清液
9. 加入100至500微升HEPENGBIO裂解液(Reagent B),充分混勻(注意:可以調(diào)節(jié)蛋白濃度)
10. 轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的1.5毫升離心管
11. 強(qiáng)力渦旋震蕩15秒
12. 置于冰槽里孵育30分鐘
13. 放進(jìn)4℃微型臺(tái)式離心機(jī)離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
14. 小心移取100至500微升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
15. 移取10微升進(jìn)行蛋白定量檢測(cè)(注意:建議使用HEPENGBIO Bradford蛋白質(zhì)濃度定量試劑盒)
16. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
二、 測(cè)定準(zhǔn)備
1. 準(zhǔn)備好待測(cè)樣品(例如細(xì)胞裂解懸液等),置于冰槽里
2. 設(shè)定好分光光度儀(溫度為30℃):波長(zhǎng)為340nm,間隔1分鐘,讀數(shù)6次(共5分鐘),并置零
3. HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)室溫下均衡溫度
三、 背景對(duì)照測(cè)定
1. 移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
3. 加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
4. 加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
5. 放進(jìn)30℃培養(yǎng)箱里靜置3分鐘
6. 加入10微升HEPENGBIO陰性液(Reagent G)
7. 上下傾倒數(shù)次,混勻(限定在3秒之內(nèi))
8. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測(cè),此為背景空對(duì)照:340波長(zhǎng)讀數(shù)0分鐘 -340波長(zhǎng)讀數(shù)5分鐘
四、 樣品測(cè)定
1. 移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
3. 加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
4. 加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
5. 放進(jìn)30℃培養(yǎng)箱里靜置3分鐘
6. 加入10微升待測(cè)樣品(注意:100微克細(xì)胞裂解蛋白;樣品須溶解)
7. 上下傾倒數(shù)次,混勻(限定在3秒之內(nèi))
8. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測(cè),此為樣品總活性讀數(shù):340波長(zhǎng)讀數(shù)0分鐘 -340波長(zhǎng)讀數(shù)5分鐘
五、 計(jì)算樣品活性
[(樣品讀數(shù)-背景讀數(shù))X 0.2(體系容量;毫升)X樣品稀釋倍數(shù)]÷[0.010(樣品容量;毫升)X 6.22(毫摩爾吸光系數(shù))X 5(反應(yīng)時(shí)間;分鐘)]=單位/毫升÷(樣品蛋白濃度)毫克/毫升=單位/毫克
單位=微摩爾NADH/分鐘
六、 酶標(biāo)儀測(cè)定
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:背景對(duì)照和樣品
2. 分別移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到96孔板里
3. 分別加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
4. 分別加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
5. 分別加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
6. 輕輕搖動(dòng)96孔板
7. 在30℃溫度下孵育3分鐘
8. 分別加入10微升HEPENGBIO陰性液(Reagent G)或待測(cè)樣品(100微克細(xì)胞裂解懸液蛋白)到相應(yīng)孔里(注意:樣品須清澈)
9. 輕輕搖動(dòng)96孔板
10. 即刻放進(jìn)酶標(biāo)儀檢測(cè):0分鐘讀數(shù)和5分鐘讀數(shù)
11. 活性計(jì)算:
[(樣品讀數(shù)-背景讀數(shù))X樣品稀釋倍數(shù)X 0.2(體系容量;毫升)]÷[0.010(樣品容量;毫升)X 6.22(毫摩爾吸光系數(shù))X 0.5(光徑距離;厘米)X 5(反應(yīng)時(shí)間;分鐘)]=單位/毫升÷(樣品蛋白濃度)毫克/毫升=單位/毫克
單位=微摩爾NADH/分鐘
七、抑制劑篩選
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:背景、完全活性和待測(cè)抑制劑樣品
2. 按下表加入試劑,進(jìn)行樣品預(yù)處理
3. 分別移取100微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的96孔板的所有孔里
4. 分別加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
5. 分別加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
6. 分別加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
7. 輕輕搖動(dòng)96孔板
8. 在30℃溫度下孵育3分鐘
9. 加入40微升上述預(yù)處理的待測(cè)樣品
10. 即刻放進(jìn)30℃酶標(biāo)儀檢測(cè):測(cè)讀0分鐘和30分鐘
11. 實(shí)際讀數(shù):0分鐘讀數(shù)—30分鐘讀數(shù)
12. 抑制活性計(jì)算:
1) [(完全活性讀數(shù)-空背景對(duì)照讀數(shù))-(抑制劑樣品活性讀數(shù)-樣本背景讀數(shù))]÷(完全活性讀數(shù)-空背景對(duì)照讀數(shù))=實(shí)際抑制百分率
2) IC50:50%抑制率所需的抑制劑濃度
X(所需抑制劑樣品濃度)=(已知抑制劑樣品濃度÷實(shí)際抑制百分率)X 50%
i. 直接構(gòu)建抑制曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光單位(OD);橫座標(biāo)(X軸)為已知抑制劑濃度
AMPK
LKKLTRASFFGQ + ATP → LKKLTRApSFFGQ + ADP
pyruvate kinase
Phosphoenolpyruvate + ADP → pyruvate + ATP
lactate dehydrogenase
pyruvate + NADH → lactate + NAD+
(高吸收峰) (低吸收峰)
產(chǎn)品內(nèi)容
HEPENGBIO清理液(Reagent A) 120毫升
HEPENGBIO裂解液(Reagent B) 10毫升
HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) 4毫升
HEPENGBIO酶促液(Reagent D) 500微升
HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E) 500微升
HEPENGBIO底物液(Reagent F) 500微升
HEPENGBIO陰性液(Reagent G) 500微升
保存方式
保存HEPENGBIO清理液(Reagent A)在4℃冰箱里;其余的保存在-20℃冰箱里,嚴(yán)格避免光照和反復(fù)凍融;有效保證6月
用戶自備
AMPK激酶:用于抑制劑篩選
1.5毫升離心管:用于樣品保存的容器
15毫升錐形離心管:用于樣品處理的容器
細(xì)胞刮脫棒:用于貼壁細(xì)胞脫離
(微型)臺(tái)式離心機(jī):用于細(xì)胞預(yù)處理
200微升1厘米光徑比色皿或96孔板:用于光度分析操作的容器
分光光度儀或酶標(biāo)儀:用于樣品光度分析
實(shí)驗(yàn)步驟
一、 待測(cè)樣品準(zhǔn)備
1. 準(zhǔn)備好75cm2細(xì)胞培養(yǎng)瓶或100mm細(xì)胞培養(yǎng)皿的待測(cè)培養(yǎng)細(xì)胞(1至5 X 107細(xì)胞)
2. 小心加入3毫升HEPENGBIO清理液(Reagent A),覆蓋生長(zhǎng)表面
3. 小心抽去清理液
4. 使用細(xì)胞刮脫棒輕柔刮脫細(xì)胞(注意:避免使用胰酶消化)
5. 加入3毫升HEPENGBIO清理液(Reagent A),混勻細(xì)胞
6. 移入到預(yù)冷的15毫升錐形離心管(注意:懸浮細(xì)胞從這一步驟開始)
7. 放進(jìn)4℃臺(tái)式離心機(jī)離心5分鐘,速度為300g
8. 小心抽去上清液
9. 加入100至500微升HEPENGBIO裂解液(Reagent B),充分混勻(注意:可以調(diào)節(jié)蛋白濃度)
10. 轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的1.5毫升離心管
11. 強(qiáng)力渦旋震蕩15秒
12. 置于冰槽里孵育30分鐘
13. 放進(jìn)4℃微型臺(tái)式離心機(jī)離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
14. 小心移取100至500微升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
15. 移取10微升進(jìn)行蛋白定量檢測(cè)(注意:建議使用HEPENGBIO Bradford蛋白質(zhì)濃度定量試劑盒)
16. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
二、 測(cè)定準(zhǔn)備
1. 準(zhǔn)備好待測(cè)樣品(例如細(xì)胞裂解懸液等),置于冰槽里
2. 設(shè)定好分光光度儀(溫度為30℃):波長(zhǎng)為340nm,間隔1分鐘,讀數(shù)6次(共5分鐘),并置零
3. HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)室溫下均衡溫度
三、 背景對(duì)照測(cè)定
1. 移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
3. 加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
4. 加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
5. 放進(jìn)30℃培養(yǎng)箱里靜置3分鐘
6. 加入10微升HEPENGBIO陰性液(Reagent G)
7. 上下傾倒數(shù)次,混勻(限定在3秒之內(nèi))
8. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測(cè),此為背景空對(duì)照:340波長(zhǎng)讀數(shù)0分鐘 -340波長(zhǎng)讀數(shù)5分鐘
四、 樣品測(cè)定
1. 移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
3. 加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
4. 加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
5. 放進(jìn)30℃培養(yǎng)箱里靜置3分鐘
6. 加入10微升待測(cè)樣品(注意:100微克細(xì)胞裂解蛋白;樣品須溶解)
7. 上下傾倒數(shù)次,混勻(限定在3秒之內(nèi))
8. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測(cè),此為樣品總活性讀數(shù):340波長(zhǎng)讀數(shù)0分鐘 -340波長(zhǎng)讀數(shù)5分鐘
五、 計(jì)算樣品活性
[(樣品讀數(shù)-背景讀數(shù))X 0.2(體系容量;毫升)X樣品稀釋倍數(shù)]÷[0.010(樣品容量;毫升)X 6.22(毫摩爾吸光系數(shù))X 5(反應(yīng)時(shí)間;分鐘)]=單位/毫升÷(樣品蛋白濃度)毫克/毫升=單位/毫克
單位=微摩爾NADH/分鐘
六、 酶標(biāo)儀測(cè)定
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:背景對(duì)照和樣品
2. 分別移取130微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到96孔板里
3. 分別加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
4. 分別加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
5. 分別加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
6. 輕輕搖動(dòng)96孔板
7. 在30℃溫度下孵育3分鐘
8. 分別加入10微升HEPENGBIO陰性液(Reagent G)或待測(cè)樣品(100微克細(xì)胞裂解懸液蛋白)到相應(yīng)孔里(注意:樣品須清澈)
9. 輕輕搖動(dòng)96孔板
10. 即刻放進(jìn)酶標(biāo)儀檢測(cè):0分鐘讀數(shù)和5分鐘讀數(shù)
11. 活性計(jì)算:
[(樣品讀數(shù)-背景讀數(shù))X樣品稀釋倍數(shù)X 0.2(體系容量;毫升)]÷[0.010(樣品容量;毫升)X 6.22(毫摩爾吸光系數(shù))X 0.5(光徑距離;厘米)X 5(反應(yīng)時(shí)間;分鐘)]=單位/毫升÷(樣品蛋白濃度)毫克/毫升=單位/毫克
單位=微摩爾NADH/分鐘
七、抑制劑篩選
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:背景、完全活性和待測(cè)抑制劑樣品
2. 按下表加入試劑,進(jìn)行樣品預(yù)處理
內(nèi)容物 | 空背景對(duì)照 | 樣本背景 | 完全酶活性 | 待測(cè)抑制劑酶活性 |
HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) | 20微升 | 20微升 | 20微升 | 20微升 |
HEPENGBIO陰性液(Reagent G) | 20微升 | 10微升 | 10微升 | —— |
待測(cè)抑制劑 | —— | 10微升 | ―― | 10微升 |
用戶自備的純化酶 | —— | —— | 10微升(1毫單位) | 10微升(1毫單位) |
96孔板每孔總量 | 空背景對(duì)照孔 (40微升) |
樣本背景孔 (40微升) |
完全活性孔 (40微升) |
待測(cè)抑制劑樣品孔 (40微升) |
輕輕搖動(dòng)96孔板,混勻,放進(jìn)30℃培養(yǎng)箱里孵育30分鐘。然后進(jìn)行下列操作 |
3. 分別移取100微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的96孔板的所有孔里
4. 分別加入20微升HEPENGBIO酶促液(Reagent D)
5. 分別加入20微升HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent E)
6. 分別加入20微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
7. 輕輕搖動(dòng)96孔板
8. 在30℃溫度下孵育3分鐘
9. 加入40微升上述預(yù)處理的待測(cè)樣品
10. 即刻放進(jìn)30℃酶標(biāo)儀檢測(cè):測(cè)讀0分鐘和30分鐘
11. 實(shí)際讀數(shù):0分鐘讀數(shù)—30分鐘讀數(shù)
12. 抑制活性計(jì)算:
1) [(完全活性讀數(shù)-空背景對(duì)照讀數(shù))-(抑制劑樣品活性讀數(shù)-樣本背景讀數(shù))]÷(完全活性讀數(shù)-空背景對(duì)照讀數(shù))=實(shí)際抑制百分率
2) IC50:50%抑制率所需的抑制劑濃度
X(所需抑制劑樣品濃度)=(已知抑制劑樣品濃度÷實(shí)際抑制百分率)X 50%
i. 直接構(gòu)建抑制曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光單位(OD);橫座標(biāo)(X軸)為已知抑制劑濃度